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Actualités

Toutes les nouveautés sur le laboratoire, les alertes sanitaires ainsi que les mises à jour réglementaires

M. BOYER

M. BOYER

Responsable scientifique

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Nouvelles compétences reconnues par le COFRAC

Nous sommes très heureux de vous faire part de la décision du COFRAC (COmité FRancais d'ACcrétation) reçue ce jour de prononcer le maintien de notre accréditation mais également l'extension de cette dernière à deux nouvelles compétences : la technique PCR ainsi que la spéctrométrie de masse MALDI-TOF.

Campylobacter

Campylobacter jejuni sur rapid'Campylobcater

Les Campylobcater sont des bactéries gram négatif mobiles, micro-aérophiles dont la morphologie incurvée, en "S" typique, explique l'origine du nom (du grec Kampulos = incurvé). Ce genre regroupe une trentaine d'espèces variées aux habitats hétérogènes. Quatre espèces sont pathogènes et responsables de toxi-infections alimentaires (Campylobacter jejuni subsp. jejuni, C. lari, C. coli et C. upsaliensis).

Les Campylobacter pathogènes sont thermotolérants ce qui permet de les distinguer au cours de l'analyse. La discrimination des espèces n'est pas aisée et peut nécessiter l'utilisation d'un spectromètre de masse (MALDI-TOF).

La campylobactériose est une des premières infections alimentaires en France et en Europe.

 

Coliformes & Entérobactéries

Klebsiella sp. (coliforme) sur gélose TTC T7 dans le cadre d'une analyse d'eau

Les coliformes sont des bactéries regroupées artificiellement au sein d’un groupe comprenant les bactéries d’origine tellurique et fécale. Ce groupe n’a pas de signification taxonomique et a pour principales caractéristiques de résister à la bile et de fermenter le lactose (définition agro-alimentaire). Dans le domaine de l'analyse d'eau, la définition d'un coliforme varie en fonction de la méthode sélectionnée (Fermentation du lactose et oxydase positive selon NF EN ISO 9308-1 v2000 ou entérobactérie exprimant une beta-galactosidase selon la version 2014).

Les entérobactéries représente une famille bien définie au point de vue biochimique. Pour autant, les méthodes de dénombrement agro-alimentaires (NF V08-054) restent peu spécifiques.

Ces groupes bactériens sont considérés comme des indicateurs techniques de la maîtrise générale de l’hygiène (contamination fécale) et des systèmes de nettoyage. Les coliformes fécaux et surtout E.coli sont des indicateurs plus performants pour signer une contamination d’origine fécale.

 

Bactéries anaérobies sulfito-réductrices, Clostridium

Colonies de Clostridium perfringens visualisé sur le dos d'une boite de pétri lors d'une analyse d'eau par filtration sur memebrane

Les bactéries anaérobies sulfito-réducteurs (ASR) est un groupe de bactéries se développant uniquement en absence d’oxygène et qui possèdent des caractéristiques biochimiques particulières, notamment la production de sulfure d’hydrogène. Dans ce groupe on retrouve principalement Clostridium perfringens mais également le groupe des Clostridium botulinum et d’autres germes capables de réduire les sulfites (certains Bacillus et streptocoques). Les Clostridi sont des germes pathogènes rencontrés en hygiène alimentaire.

Dans le cadre des analyses d'eau, les ASR sont utilisés comme témoin de la qualité de filtration et/ou marqueur d'une contamination fécale

 

Analyse de biologie moléculaire par PCR

Nous sommes très heureux de vous informer de la disponibilité des analyses PCR à Vigilab. Après plusieurs mois de tests et de vérification, nous sommes en capacité de vous proposer plusieurs analyses de microbiologie des aliments en biologie moléculaire avec des résultats en moins de 24h.

Identification microbienne ultra-rapide par spectrométrie de masse

Le laboratoire est heureux de vous faire part de l'installation au laboratoire d'un spectromètre de masse MALDI-TOF pour l'identification microbienne.

Cet équipement de pointe est le premier en Corse pour l'identification des pathogènes alimentaires et l'un des premiers en France.

Staphylocoques coagulase +

Staphylococcus aureus sur Baid Parker + RPF. Analyse d'un échantillon d'eauLe nom de staphylocoques à pour origine son aspect en grappe observable au microscope. Ces bactéries sont isolées à partir d'infection purulentes chez les patients dès la fin du XIXème siècle. La première toxi-infection alimentaire collective documentée date quant à elle des années 1920. Les staphylocoques sont ces coques gram+ catalase + isolés, en paires ou en amas, Staphylococcus aureus formant notamment des groupements en forme de "grappe de raisin".  Staphylococcus aureus est le principal responsable de TIAC bien que d'autres espèces aient été identifiées au cours d'épisodes toxiques .

 

Bacillus cereus

Bacillus cereusC'est à la suite d'épidémies de gastroentérites survenue dans les années 1950 en norvège de la Bactérie a été détectée. Génétiquement Bacillus cereus au sens strict est très broche d'autres espèces de ce que qu'on appelle "le Groupe Bacillus cereus"  : B. anthracis, B. thuringiensis, B. mycoïdes, B. pseuomycoïdes, B. weihenstephanensis et B. cytotoxicus. Attention, anthracis, cereus et thuringiensis représentent en fait la même espèce que l'on peut différencier par des facteurs de virulence. Ces facturs de virulence sont portés par des plasmides, leur présence n'est donc pas systématique. Au sens strict B. cereus forme de gros bacilles (1µm x 5µm, voir plus en fonction des conditions culturales) gram + formant des spores subterminales non déformantes. Ilspeuvent se développer en aérobiose comme en anaérobiose. La bactérie résiste à un traitement de pasteurisation grâce à ses spores. A noter que Bacillus cereus sensus lato est également utilisé dans le cadre de la lutte biologique contre les insectes.

 

Escherichia coli

Gram E.coliIsolée pour la première fois par Theodor Escherich en 1885, le nom définitif d'Escherichia coli ne sera attribué qu'en 1987. Il s'agit de l'espèce principale de la microflore intestinale considérée comme non pathogène. Toutefois certaines souches dites entérohémorrhagiques (ou STEC pour Shiga Toxin E. Coli) sont responsables de toxi-infections graves notamment chez les enfants. L'espèce appartient à la famille des entérobactéries. Elles mesurent 1 à 2 µm de longueur et peuvent se développer en aérobiose comme en anaérobiose. Elle ne résiste pas à un traitement de pasteurisation.

Histamine

Molécule d'histamine. Crédit : Jynto

L'histamine ou 4-(2-aminoethyl)imidazole, comme la cadavérine, putrescine, spermine, spermidine... sont des amines biogènes naturellement présentes chez l'homme mais aussi chez les animaux et les plantes. Ces molécules ont une action sur le système nerveux central, le système vasculaire, gastrique. L'histamine intervient comme neurotransmetteur dans les phénomènes allergiques et inflammatoires et provient de la décarboxylation d'un acide aminé, l'histidine, par l'action d'une enzyme présente chez certains micro-organismes et cellules humaine : l'histidine décarboxylase.

La quantité d'histidine est réglementée dans les produits alimentaires ( Règlement 2073/2005 CE.) : Produits de pêche : 100 mg/kg, produits de la pêche maturés, saumurés : 200mg/kg, sauce de poisson produite par fermentation : 400mg/kg

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